La date de la fondation officielle de l'hopital St Jacques de Toulouse est 1257, lorsque le prieur de la Daurade, Bertrand de Saint Genies confie le batiment a la confrerie Saint Jacques.
L'hopital Sainte Marie de la Daurade et l'hopital Nouvel sont reunis pour former l' Hopital Saint Jacques du Bout-du-Pont qui s'agrandira encore au fil des siecles.
En 1554, il devient l'Hotel-Dieu. Il sert a cette epoque plus pour accueillir les pelerins sur la route de Saint Jacques de Compostelle que pour soigner.
Il retrouvera sa fonction d'hopital au 17eme siecle.
L'institution souffre beaucoup sous la revolution. Toulouse est devenue Jacobine et les hopitaux Biens Nationaux. Prives des ressources catholiques, ils courent a la faillite.
Heureusement au 19eme siecle des travaux sont entrepris et en 1814 l'Hotel Dieu accueille et soigne les blesses des deux camps durant la bataille entre les troupes francaises et les troupes anglo-espagnoles. Il en sera de meme durant les deux guerres mondiales.
En 1987 le dernier service d'hospitalisation quitte l'Hotel Dieu. Le site abrite dorenavant le service administratif du CHU, le Musee d'Histoire de la Medecine ainsi qu'un laboratoire de recherches consacrees a l'etude de la peau.